مجلة العلوم الزراعية والبيئية والبيطرية

دراسة وتحليل الجين (BMPR2) عن طريق (SNPs) باستخدام برمجيات الحاسب الآلي

In silico analysis of single nucleotide polymorphism (SNPs)
in human [BMPR2] gene

Mohamed Saeed Elhassan Mohamed

Hind AbdelAziz Elnasri

Afraa Mohamed Elbakri

Mona Abdelrahman Mohamed. Khaeir

University of Bahri || College of Veterinary Medicine || Sudan

DOI PDF

Tab title
Background: (BMPR2) gene is encoded gene and cause pulmonary arterial hypertension. Also, it has major role in regulating the growth the maturation of cells. A (BMPR2) gene contains only 25 SNPs as deleterious SNPs and was analyzed in this study.  Material and methods: 25 SNPs investigated using the NCBI database (htt: / / www.ncbi.nlm.nih.gov/)and the SNPs were analyzed using six prediction tools: SIFT, Polyphen- 2, I- Mutant, PROVEAN, PhD- SNP and Project Hope. 76% SNPs predict Probably Damaging by POLYPHEN software. the protein stability checked by I- MUTANT and 72% SNPs trend to decrease effected. when used SNPs & GO 52% SNPs were diseased.64% SNPs were deleterious by PROVEAN. There are 20 associated genes, 14 genes share the same protein domains and 13 genes similar in their expression when predicted by GENE MANIA software. Using PROJEC HOPE software to predict the structural effect in function. Result: eight SNPs of 25 SNPs were sharing the same and significant results, so that leads to confirm this result. Conclusions: eight SNPs, rs137852744, rs137852745, rs137852746, rs137852749, rs137852750, rs137852750, rs143740797and rs374694591 were shown to have highly damaging and cause the pulmonary arterial hypertension disease. Keywords: SIFT, Polyphen2, BMPR2 gene, pulmonary hypertension, in silico. SNPs.

دراسة وتحليل الجين (BMPR2) عن طريق (SNPs) باستخدام برمجيات الحاسب الآلي

محمد سعيد الحسن محمد

هند عبد العزيز النصري

عفراء محمد البكري

منى عبد الرحمن محمد خير

كلية الطب البيطري || جامعة بحري || السودان

Tab title
الجين المعني بالدراسة والمعروف اختصارًا (BMPR2) هو الجين المسئول عن توازن ضغط الدم في الشريان الرئوي في جسم الإنسان، كما أن له دور كبير في تنظيم نمو الخلايا. ولما يكون هنالك عطب في هذا الجين لا يتمكن جسم الإنسان من أداء دوره بصورة طبيعية، فيصاب عندها بضغط الدم وتحديداً في الشريان الرئوي كما يتأثر نمو الخلايا سلباً. في هذه الدراسة استخدمنا برمجيات حاسوبية عالية الدقة في تحديد الجزء من الجين والذي تحدث فيه هذه الإشكالات وقمنا بتحديدها. وفي الدراسات السابقة كان هذا الجين هو المتهم أيضاً بهذه المشكلة. لكن لم يتم تحديد الجزء داخل الجين المسؤول عن هذه المشكلة، بالرغم من ظهور بعض هذه الأجزاء في دراسات سابقة. من مميزات هذه الدراسة استخدام عدد من الخوازميات الحديثة، توفر الجهد والوقت والمال للعمل فقط على جزء معين من الجين وليس كله. الكلمات المفتاحية: الخوازمية سيفت- الخوارزمية بوليفين- الخوارزمية ايميوتين- الخوازمية سنيب اند قو- الخوازمية جين مينيا- استخدام الخوازميات الحاسوبية- ضغط الدم في الشريان الرئوي.

اترك تعليقاً

==> أرسل بحثك <==